南通福田寺，又称钟秀山寺。开山于赵宋，重兴于民国。据史料记载，古通州城因南边有狼五山并列，而城北平壤雉堞，南高北低，故“风水不聚”。明隆庆年间，州府在城北人工筑土五座（即北土山），以校正风水。明隆庆三年（1596），又在北五山中间的钟秀山，重修福田寺，“以形制备”，与南五山中间的狼山广教寺对应，共护南通城的繁盛。昔时大殿内毗卢佛高踞莲台，以千佛绕毗卢，香花二圣，梵王、帝释随侍两旁。殿前高悬“大富贵亦寿考”匾额。为通州九大寺之一。民国二年（1913)，清末状元张謇将60岁寿礼捐赠福田寺。民国十一年（1922），福田寺续修时，又亲笔题寺名。 建国后，全市教产登记：福田寺坐北朝南，占地10亩8分，有山门、正殿、厢房等共31间，约590平方米。大跃进的1958年，为建元件二厂，拆去28间，所剩佛殿现改为南通市烈士陵园。 2001年8月，港闸区政府顺应民意，在北临通刘河、南依唐闸古镇，这块民风淳朴，佛缘深厚的陈桥河口，复建福田寺。同样喻意与狼山广教寺共护今天的南通城。多年来，南通福田寺发扬佛教爱国爱教优良传统，秉承 “人间佛教”思想，深入开展“宗教政策法规学习月” 、“教风建设年”、星级场所创建活动，强化人员的持戒意识，建立健全简明完备的议事程序和行事规则，完善各项制度，严格做好教职人员的认定备案工作，场所各项管理规范有序，成为南通市及港闸区重要的对外接待窗口之一，多次被评为南通市文明暨和谐宗教活动场所。

寺院根据自身特点打造园林式寺院，因地制宜建成了山门天王殿、圆通殿、大雄宝殿、藏经楼、玉佛殿、毗卢阁、钟鼓楼、尊胜石经幢、见山楼、菩提书院、增福楼、印月山房、放生池、东西厢房等建筑，进一步完善寺院功能，为广大信众提供接受佛陀教育的规范场所。寺院加强档案的建设与管理，邀请专业人员到寺指导，并赴相关场所进行学习取经，按照省档案工作三星级标准建立了档案室,为场所管理规范化，推动星级宗教活动场所创建工作奠定了良好的基础。寺院践行人间佛教理念，积极参与社会公益及文化事业，成立了南通市福田寺慈善基金功德会，开展扶贫济困、捐资助学助残、救助大病儿童、看望孤寡老人、资助少数民族学生等活动以回报社会，在社会上产生了一定的影响。