北京理工大学良乡校区是落实2000年9月23日《国防科工委、教育部、北京市人民政府关于重点共建北京理工大学协议》精神而新建的校区，按照三方共建协议，北京市政府承诺在房山区良乡高教园区向学校无偿提供200公顷办学用地。2002年10月22日，房山区人民政府与北京理工大学签订《合作共建北京理工大学协议》。2003年11月25日，原国防科工委批复《北京理工大学良乡校区规划建设方案》。2005年11月，学校正式启动良乡校区建设。经过近2年的建设，2007年9月17日，良乡校区迎来第一批3300名2007级本科生入住，标志着良乡校区正式投入使用。2010年，中央景观区建设位置进行调整，以便于学校运行管理，保证校区完整性。2015年11月28日，北京理工大学正式开启良乡校区建设的“东区”时代。

截止到目前，学校现有总建筑面积33.44万平方米（不含在建的大学生工程实践训练中心、文体中心和三期基础设施5.18万平方米），投入建设资金近15亿元，形成了以“理科教学楼、综合教学楼、徐特立图书馆等”为代表的教学实验区约10万平方米；以“疏桐园、静园、丹枫园等”为代表的宿舍区约10万平方米；以“食堂、学生服务中心、运动场地等”为代表的的生活配套区约13万平方米。已经形成配套齐全、能够满足10000名学生学习和生活需要的格局（数据截至2017年3月）。

学校积极探索多校区管理运行新模式，经过10年的探索，形成了“条”“块” 结合，“纵”“横” 交错的管理模式。目前校区本科生近9000人，研究生610人，留学生300余人。化学与化工学院、人文与社会科学学院、数学与统计学院、马克思主义学院已整体搬迁入驻良乡校区。良乡校区管理处、基建处、学生事务中心、学生工作处、团委、分析测试中心等6个机关单位整建制入驻良乡校区。2个国家级教学示范中心、2个省部级重点实验室、6个省部级教学示范中心、9个素质教育创新实践基地在良乡校区落地（数据截至2017年3月）。