2012年6月10日“浙江大学-舟山市人民政府共建浙江大学舟山校区（浙江大学海洋学院）合作协议”签约仪式在杭州举行。浙江大学和舟山市政府共建浙大舟山校区，总投资28个亿，校区选址于舟山市临城惠民桥新区，总建筑面积24万平米的校园于2012年动工，并且已在2015年完工。浙江大学海洋学院将依托舟山新区的天然优势发展浙大海洋学科。浙江大学舟山校区作为浙江大学本部第六个校区已于2015年9月投入使用。

根据浙江大学-舟山市人民政府共建浙江大学舟山校区（浙江大学海洋学院）合作协议，双方将共建以海洋教学与科研为特色的浙江大学舟山校区（浙江大学海洋学院），依托舟山得天独厚的海洋区位优势和舟山群岛新区建设的有利时机，携手打造高水平海洋科教基地和海洋人才高地。

浙江大学海洋学院定位为专业型、研究型学院，以本科生培养为基础，以涉海专业研究生培养为重点，同时积极打造高层次继续教育人才培养体系。